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  • Measuring adaptation dynamics to hydrogen peroxide in single human cells using fluorescent reporters D Simiuc, F Dahmani, A Pruvost, M Guilbert, M Brulé, C Lagadec, Q Thommen, B Pfeuty, E Courtade, F Anquez bioRxiv 2020.11.14.382911;

Publication dans une revue internationnale à comité de lecture

  • M Layachi, A Treizebre, L Hay, D Gilbert, J Pesez, Q D’Acremont, K Braeckmans, Q Thommen and E Courtade  Novel opto‐fluidic drug delivery system for efficient cellular transfection Journal of Nanobiotechnology https://doi.org/10.1186/s12951-023-01797-3 (2023)
  • Q Thommen, J Hurbain, B Pfeuty Stochastic simulation algorithm for isotope-based dynamic flux analysis Metabolic Engineering 75, 100-109 (2022)
  •  J Hurbain, Q Thommen, F Anquez, B Pfeuty Quantitative modeling of pentose phosphate pathway response to oxidative stress reveals a cooperative regulatory strategy Iscience 25 (8), 104681 (2022)
  •  M Guilbert, E Courtade, Q Thommen Cellular Environment and Phenotypic Heterogeneity: How Data-Driven Modeling Finds the Smoking Gun. Int. J. Mol. Sci.  23, 6536 (2022). doi.org/10.3390/ijms23126536

 

2016-2021

  • B Pfeuty, E Courtade, Q Thommen Fine-tuned control of stress priming and thermotolerance, Physical biology 18 (4), 04LT02 (2021)
  •  J Hurbain, D Labavić, Q Thommen, B Pfeuty Theoretical study of the impact of adaptation on cell-fate heterogeneity and fractional killing Scientific Reports 10 (1), 1-13 (2020)
  • Guilbert, M., Anquez, F., Pruvost, A., Thommen, Q. and Courtade, E., Protein level variability determines phenotypic heterogeneity in proteotoxic stress response. FEBS J. doi:10.1111/febs.15297 (2020) 
  • D Labavic, MT Ladjimi, E Courtade, B Pfeuty, Q Thommen Mammalian Cell Sensitivity to Hyperthermia in Various Cell Lines : A new universal and predictive description  International Journal of Hyperthermia, 37, 506-516 (2020)
  • Ladjimi, M. T.;  Labavic, D.;  Guilbert, M.;  Anquez, F.;  Pruvost, A.;  Courtade, E.;  Pfeuty, B.;  Thommen, Q.,  Dynamical thermal dose models and dose time-profile effects  International Journal of Hyperthermia DOI: 10.1080/02656736.2019.1633478 (2019)
  • D. Labavic, M. T.  Ladjimi, Q.  Thommen, B. Pfeuty, Scaling laws of cell-fate responses to transient stressJournal of Theoretical Biology  DOI: 10.1016/J.JTBI.2019.06.014 (2019) 
  • A. Sivéry, E. Courtade and Q. Thommen, A minimal titration model of the mammalian dynamical heat shock response, Phys. Biol. 13, 066008 (2016).
  • B. Pfeuty and Q. Thommen, Adaptive Benefits of Storage Strategy and Dual AMPK/TOR Signaling in Metabolic Stress Response, Plos One 11, e0160247 (2016).

2009--2015

  • Q. Thommen, B. Pfeuty, P. Schatt, A. Bijoux, F.-Y. Bouget, M. Lefranc,  Probing entrainment of ostreococcus tauri circadian clock by blue and green light through a mathematical modeling approachFrontiers in Genetics 5, 00065 (2015).
  • F.-Y. Bouget, M. Lefranc, Q. Thommen, B. Pfeuty, J.-C. Lozano, P. Schatt, H. Botebol, V. Vergé, Transcriptional versus non-transcriptional clocks: A case study in Ostreococcus, Marine Genomics 14, 17 (2014).
  • J. Wang, B. Pfeuty, Q. Thommen, M. C. Romano, M. Lefranc, Minimal model of transcriptional elongation processes with pauses, Phys. Rev. E 90, 050701 (2014).
  • J. Wang, M. Lefranc, Q. Thommen, Stochastic oscillations induced by intrinsic fluctuations in a self-repressing gene, Biophys. J. 107, 2403 (2014).
  • B Pfeuty, Q Thommen, F Corellou, EB Djouani‐Tahri, FY Bouget, M Lefranc, Circadian clocks in changing weather and seasons: Lessons from the picoalga Ostreococcus tauri, Bioessays 34 (9), 781-790 (2012)
  • Q Thommen, B Pfeuty, F Corellou, FY Bouget, M Lefranc Robust and flexible response of the Ostreococcus tauri circadian clock to light/dark cycles of varying photoperiod The FEBS journal 279 (18), 3432-3448 (2012)
  • Q Thommen, JC Garreau, V Zehnlé Quantum motor: Directed wave-packet motion in an optical lattice Physical Review A 84 (4), 043403 (2011)
  • B Pfeuty, Q Thommen, M Lefranc Robust entrainment of circadian oscillators requires specific phase response curves Biophysical journal 100 (11), 2557-2565 (2011)
  • PE Morant, Q Thommen, B Pfeuty, C Vandermoere, F Corellou, FY Bouget, M Lefranc, A robust two-gene oscillator at the core of Ostreococcus tauri circadian clock Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science 20 (4), 045108 (2010)
  • Q Thommen, B Pfeuty, PE Morant, F Corellou, FY Bouget, M Lefranc Robustness of circadian clocks to daylight fluctuations: hints from the picoeucaryote Ostreococcus tauri PLoS computational biology 6 (11), e1000990 (2010)
  • PE Morant, Q Thommen, F Lemaire, C Vandermoëre, B Parent, M Lefranc, Oscillations in the expression of a self-repressed gene induced by a slow transcriptional dynamics Physical review letters 102 (6), 068104 (2009)

2002-2006

Q Thommen, P Mandel
Left-handed properties of erbium-doped crystals
Optics letters 31 (12), 1803-1805 (2006)
Q Thommen, P Mandel
Electromagnetically induced left handedness in optically excited four-level atomic media
Physical review letters 96 (5), 053601 (2006)
Q Thommen, JC Garreau, V Zehnlé
Quantum interference in a driven washboard potential
American journal of physics 72 (8), 1017-1025 (2004)
Q Thommen, JC Garreau, V Zehnlé
Atomic motion in tilted optical lattices: an analytical approach
Journal of Optics B: Quantum and Semiclassical Optics 6 (7), 301 (2004)
Q Thommen, JC Garreau, V Zehnlé
Classical chaos with Bose-Einstein condensates in tilted optical lattices
Physical review letters 91 (21), 210405 (2004)
Q Thommen, V Zehnlé, JC Garreau
Wave-packet reconstruction via local dynamics in a parabolic lattice
Physical Review A 67 (1), 013416 (2003)
Q Thommen, JC Garreau, V Zehnlé
Theoretical analysis of quantum dynamics in one-dimensional lattices: Wannier-Stark description
Physical Review A 65 (5), 053406 (2002)
P Dubois, Q Thommen, AC Jambon
In vivo measurement of surgical gestures
IEEE Transactions on Biomedical Engineering 49 (1), 49-54 (2002)

Brevets publiés

* K Braeckmans, R Xiong, M Layachi, A Treizebre, F Anquez, Q Thommen, E Courtade 
Procédé et dispositif pour fournir un écoulement microfluidique 
WO2020221883A1 (2020) 
 * A. Treizebre, Q. Thommen, J. Pesez, H. Damart, L. Liegois, E. Courtade
Dispositif et procédé de discrimination de spermatozoïdes
FR3061910 (2018).
* L. Liegeois, E. courtade H. Damart, J. Pesez, Q, Thommen, A.Treizebre,
Dispositif et procédé de sélection de cellules eucaryotes dans un canal de transport par altération des cellules eucaryotes au moyen d’un rayonnement électromagnétique
FR3024738 A1 – WO2016024061A1 (2016).

Actes publiés de conférence

• Une horloge biologique à l’heure par tout temps et en toute saison Q Thommen, B Pfeuty, F Corellou, FY Bouget, M Lefranc Résumés des exposés de la 15e Rencontre du Non-Linéaire Paris 2012, 41.

• Stochastic resonance in a self-repressing gene with transcriptional memory J Wang, Q Thommen, M Lefranc Résumés des exposés de la 15e Rencontre du Non-Linéaire Paris 2012, 215

• Dynamique du gene auto–reprimé avec mémoire transcriptionnelle J Wang, Q Thommen, M Lefranc Résumés des exposés de la 15e Rencontre du Non-Linéaire Paris 2012, 40

• Oscillations d’expression d’un gene auto-régulé : interaction d’un délai de transport avec la réponse transcriptionnelle J Wang, Q Thommen, M Lefranc Résumés des exposés de la 13e Rencontre du Non-Linéaire Paris 2010, 52 2010

• Robustesse des horloges circadiennes aux fluctuations d’éclairement : le cas du picoeucaryote Ostreococcus Q Thommen,PE Morant, F Corellou, FY Bouget, M Lefranc Résumés des exposés de la 13e Rencontre du Non-Linéaire Paris 2010, 50

• Une horloge circadienne minimale chez l’algue unicellulaire Ostreococcus tauri PE Morant, F Corellou, Q Thommen, C Schwartz, C Vandermoëre, . . . Résumés des exposés de la 12e Rencontre du Non-Linéaire Paris 2009, 21

• Oscillations induites par une dynamique transcriptionnelle lente dans l’expression d’un gene réprimé par sa propre protéine PE Morant, Q Thommen, F Lemaire, C Vandermoere, B Parent, M Lefranc Résumés des exposés de la 11e Rencontre du Non-Linéaire Paris 2008, 43

• Modélisation de l’horloge circadienne de l’algue Ostreococcus tauri F Corellou, C Schwartz, PE Morant, Q Thommen, C Vandermöere, . . . Résumés des exposés de la 11e Rencontre du Non-Linéaire Paris 2008, 41

• Modeling of the circadian clock of the green unicellular alga Ostreococcus tauri and nonlinear dynamics of simple genetic oscillators PE Morant, Q Thommen, F Corellou, C Schwartz, C Vandermoere, . . . Modelling Complex Biological Systems, 85

• Oscillateurs génétiques simples. Application a l’horloge circadienne d’une algue unicellulaire PE Morant, C Vandermoere, Q Thommen, B Parent, F Lemaire, F Corellou, . . . Résumés des exposés de la 10e Rencontre du Non-Linéaire Paris 2007, 18

• Chaos Classique avec un objet quantique Q Thommen, JC Garreau, V Zehnlé Résumés des exposés de la 9e Rencontre du Non-Linéaire Paris 2006, 53