Pierre Pericard

Ingénieur de recherche - Bioinformatique
  • Laboratoire / équipe
    • UMS 2014 - US 41 - PLATEFORMES LILLOISES EN BIOLOGIE ET SANTE
  • Composantes, facultés
  • Domaines de recherche

    Analyse de données de séquençage, Développement de pipelines, Transcriptomique, Métagénomique, Galaxy

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Pierre Pericard

Ingénieur de recherche - Bioinformatique
  • UMS 2014 - US 41 - PLATEFORMES LILLOISES EN BIOLOGIE ET SANTE

Publications

Article dans des revues

  • Asma Khelifa, Cecilia Guillen Sanchez, Kevin Lesage, Ludovic Huot, Thomas Mouveaux, et al.. TgAP2IX-5 is a key transcriptional regulator of the asexual cell cycle division in Toxoplasma gondii. Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12, pp.116. ⟨10.1038/s41467-020-20216-x⟩. ⟨hal-03107529v2⟩
  • Simon Dittami, Erwan Corre, Loraine Brillet-Guéguen, Agnieszka Lipinska, Noé Pontoizeau, et al.. The genome of Ectocarpus subulatus – A highly stress-tolerant brown alga. Marine Genomics, Elsevier, 2020, 52, pp.100740. ⟨10.1016/j.margen.2020.100740⟩. ⟨hal-02866117⟩
  • Pierre Pericard, Yoann Dufresne, Loïc Couderc, Samuel Blanquart, Hélène Touzet. MATAM: reconstruction of phylogenetic marker genes from short sequencing reads in metagenomes. Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2017, 34 (4), pp.585-591. ⟨10.1093/bioinformatics/btx644⟩. ⟨hal-01646297v2⟩
  • Franck Giacomoni, Gildas Le Corguillé, Misharl Monsoor, Marion Landi, Pierre Pericard, et al.. Workflow4Metabolomics: A collaborative research infrastructure for computational metabolomics. Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2015, 31 (9), pp.1493-1495. ⟨10.1093/bioinformatics/btu813⟩. ⟨hal-01123263⟩
  • Ronan Lagadec, Laurent Laguerre, Arnaud Menuet, Anis Amara, Claire Rocancourt, et al.. The ancestral role of nodal signalling in breaking L/R symmetry in the vertebrate forebrain. Nature Communications, Nature Publishing Group, 2015, 6, pp.6686. ⟨10.1038/ncomms7686⟩. ⟨hal-01138938⟩

Communication dans un congrès

  • Pierre Pericard, Yoann Dufresne, Samuel Blanquart, Hélène Touzet. Reconstruction of full-length 16S rRNA sequences for taxonomic assignment in metagenomics. JOBIM 2017 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2017, Lille, France. ⟨hal-01574629⟩
  • Evguenia Kopylova, Laurent Noé, Pierre Pericard, Mikaël Salson, Hélène Touzet. SortMeRNA 2: ribosomal RNA classification for taxonomic assignation. Workshop on Recent Computational Advances in Metagenomics, ECCB 2014, Sep 2014, Strasbourg, France. ⟨hal-01094011⟩
  • Pierre Péricard, Gildas Le Corguille, Ursula Czerwinska, Marion Landi, Franck Giacomoni, et al.. A small step into Galaxy, a faster pace for metabolomics. Galaxy and the metabolomics analysis Universe. JOBIM 2013 Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jul 2013, Toulouse, France. ⟨hal-02806218⟩
  • Pierre Pericard, Gildas Le Corguillé, Ursula Czerwinska, Marion Landi, Franck Giacomoni, et al.. Vers une "Galaxy" Métabolomique?. 7. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et de Fluxomique (RFMF), Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF). FRA., Jun 2013, Amiens, France. ⟨hal-02748261⟩

Poster

  • Marion Landi, Mélanie Petera, Mishari Monsoor, Gildas Le Corguillé, Christophe Duperier, et al.. Factory and Libraries for Automatic Metabolomic Exploration : F.L.A.M.E. 8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 2014. ⟨hal-02743239⟩
  • Christophe Caron, Wilfried Carre, Alexandre Cormier, Sandra Derozier, Franck Giacomoni, et al.. Towards a cyber Galaxy ?. JOBIM 2013, Jul 2013, Toulouse, France. pp.246, 2013, JOBIM TOULOUSE 2013 - RÉSUMÉS COURTS (affiches). ⟨hal-02748994⟩
  • Christophe Caron, Wilfrid Carré, Alexandre Cormier, Sandra Derozier, Franck Giacomoni, et al.. Toward a French cyber Galaxy ?. Galaxy Community Conference, Jun 2013, Oslo, Norway. 2013, Galaxy Community Conference 2013 : Posters / Abstracts. ⟨hal-02748274⟩

Pré-publication, Document de travail

  • Simon Dittami, Erwan Corre, Loraine Brillet-Guéguen, Agnieszka Lipinska, Méziane Aite, et al.. The genome of Ectocarpus subulatus -a highly stress-tolerant brown alga. 2019. ⟨hal-02333021⟩

Thèse

  • Pierre Pericard. Algorithmes pour la reconstruction de séquences de marqueurs conservés dans des données de métagénomique. Bio-informatique [q-bio.QM]. Université de Lille, 2017. Français. ⟨NNT : 2017LIL10084⟩. ⟨tel-01738687v2⟩